مولد تسلسلات DNA / RNA
مرشد
مولد تسلسلات DNA / RNA
توليد سلاسل عشوائية من DNA و RNA بتحكم دقيق في محتوى G و C، وتنظيمها كملفات FASTA، وتحويل بين السلاسل دون مغادرة المتصفح. مُصمم خصيصًا للطلاب، والباحثين في مجالات البيولوجيا، والمبرمجين الذين يحتاجون إلى بيانات اختبار سريعة مع تحكم إحصائي يُمكن أن لا يوفره المساعدات النصية المبنية على النص.
كيفية استخدام
- اختر عملية — توليد سلسلة عشوائية من DNA أو RNA، أو تحويل سلسلة موجودة (مُكمل، مُكمل عكسي، توليد، أو توليد عكسي).
- للاستنتاج، قم بتحديد طول السلسلة، مقياس محتوى G و C المستهدف، وعدد السلاسل للإخراج الجماعي. قم بتفعيل رموز التباين IUPAC إذا كنت بحاجة إلى مواقع متعددة.
- للاستبدال، الصق السلسلة المدخلة — يتم تجاهل الرؤوس في FASTA، والمسافات، والأرقام تلقائيًا.
- اختر تنسيق الناتج (بسيط أو FASTA) وعرض السطر، ثم اضغط إنتاج. يُعرض جدول الإحصائيات محتوى GC%، محتوى AT/AU%، وعدد القواعد لكل قاعدة بشكل مباشر.
- انسخ أو احفظ النتيجة كـ
.fastaملف.
خصائص
- سادس أنماط التشغيل – توليد سلسلة عشوائية من DNA، توليد سلسلة عشوائية من RNA، مُكمل، مُكمل عكسي، توليد من DNA إلى RNA، وتحويل عكسي من RNA إلى DNA.
- التحكم الدقيق في محتوى G و C – اختيار أي قيمة مستهدفة من 0 إلى 100؛ يقوم المولد بوضع عدد دقيق من قواعد G و C وتقسيمها على طول السلسلة.
- Batch generation – إنتاج ما يصل إلى 50 سلسلة مستقلة في نقرة واحدة لتجارب تكرارية أو مجموعات بيانات اختبار.
- مخرج FASTA – رؤوس مُعدّة تلقائيًا (
>seq_1 length=100) مع مُسبّب قابل للتعديل وانحناء السطر عند أي عرض يصل إلى 200. - رموز التباين IUPAC – إدخال خياري للقواعد المتعددة (R، Y، S، W، K، M، N) لتصميم المُبادئ وسيناريوهات متعددة الأليلات.
- إحصائيات السلسلة الحية – يُحدث محتوى الطول الكلي، محتوى G و C%، محتوى A و U%، وعدد القواعد لكل قاعدة تغييرًا مع كل تغيير.
- مُعتمد بالجهاز فقط – يتم توليد السلاسل داخل المتصفح — لا يتم تحميل أي شيء أو تسجيله.
التعليمات
-
ما هو محتوى G و C وما السبب في أهميته؟
محتوى G و C هو النسبة المئوية لقواعد الجوانب G و C في جزيء الحمض النووي. لأن أزواج G–C تمتلك 3 روابط هيدروجين مقارنة بـ 2 في أزواج A–T، فإن المناطق ذات المحتوى العالي لـ G و C تمتلك درجة ارتفاع في درجة الذوبان وثبات هيكلية. كما أن محتوى G و C يتغير بشكل منظم بين الكائنات والمناطق الجينية، لذا فإن التحكم فيه مهم عند تصميم المُبادئ، أو إنشاء بيانات مُصاغة بشكل واقعي، أو نمذجة أنواع محددة.
-
ما الفرق بين المُكمل والمُكمل العكسي؟
المُكمل للسلسلة يُستبدل كل قاعدة بزميلها في الـ Watson–Crick (A↔T، G↔C، A↔U للـ RNA) مع الحفاظ على اتجاه القراءة من 5′ إلى 3′. أما المُكمل العكسي فيقوم بالاستبدال نفسه ثم يعكس السلسلة بحيث يمثل تسلسل السلسلة المقابلة المُقاسة من 5′ إلى 3′. ويُعد المُكمل العكسي ما يريده العلماء عند استخلاص السلسلة المقابلة من جزيء مزدوج.
-
ما الفرق بين التوليد والتحويل العكسي؟
التحويل هو العملية البيولوجية التي تُنسخ منها سلسلة DNA إلى RNA، وهو يُعادل تبديل كل تيمين (T) بـ U. أما التحويل العكسي فهو العكس — تحويل جزيء RNA إلى DNA مُكمل (cDNA) بتعويض كل U بـ T. يستخدم الخلايا الحقيقية إنزيمات (البوليمراز للـ RNA ونُسخة العكس) لهذه التحولات؛ أما التحويل على مستوى السلاسل فهو مجرد تبديل للرموز.
-
ما هي رموز التباين IUPAC المستخدمة لها؟
رموز الحمض النووي IUPAC هي رموز مكونة من حرف واحد تمثل مواقع قد توجد فيها قواعد متعددة. يمثل R الألواح (A أو G)، Y للحمض النووي (C أو T/U)، S للقوس القوي (G أو C)، W للقوس الضعيف (A أو T/U)، K للحمض الكيتوني (G أو T/U)، M للحمض الأميني (A أو C)، وN لأي قاعدة. تُستخدم بشكل شائع في تصميم المُبادئ، والأنماط المُتفق عليها، والمقارنات بين السلاسل المتعددة حيث تكون المواقع متعددة أو غير معروفة.
-
ما هو تنسيق FASTA؟
FASTA هو تنسيق نصي لتمثيل سلاسل الحمض النووي أو البروتين. تبدأ كل مدخلة بخط وصف يبدأ برمز أكبر من (>)، يليه معرف وبيانات اختيارية، ثم يليه خط أو أكثر من أحرف السلسلة. عادة ما يتم تضمين السلاسل عند 60 أو 80 حرفًا في كل سطر. يُعد FASTA اللغة المُستخدمة في أداة البيولوجيا لأنها قابلة للقراءة من قبل الإنسان وسهلة التحليل.
تثبيت ملحقاتنا
أضف أدوات IO إلى متصفحك المفضل للوصول الفوري والبحث بشكل أسرع
恵 وصلت لوحة النتائج!
لوحة النتائج هي طريقة ممتعة لتتبع ألعابك، يتم تخزين جميع البيانات في متصفحك. المزيد من الميزات قريبا!
أدوات يجب تجربتها
عرض الكلشارك
ساعدنا على الاستمرار في تقديم أدوات مجانية قيمة
